期刊简介
主要报道和刊登国内外、特别是我国消化病学者具有创造性的、有较高学术水平的基础和临床研究论文、研究快报等. 对具有中国特色的研究论文, 如食管癌、胃癌、肝癌、大肠癌、病毒性肝炎、幽门螺杆菌、中医中药、中西医结合和基于作者自己研究工作为主的综述性论文, 将优先发表. 读者对象为基础研究或临床研究的消化专业工作者。
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首页>世界华人消化杂志
- 杂志名称：世界华人消化杂志
- 主管单位：华人消化杂志；新消化病学杂志
- 主办单位：山西省科学技术厅
- 国际刊号：14-1260/R
- 国内刊号：14-1260/R
- 出版周期：旬刊
期刊荣誉：国家期刊奖百种重点期刊（第二和第三届）期刊收录：上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 文摘与引文数据库, 维普收录(中), 医学文摘, 知网收录(中), CA 化学文摘(美), 万方收录(中)
胃癌弱差异基因表达谱建立的生物学意义
孙伟；高芳；龙启福；王晓龙；朱德锐；顾存林；安娟；党国全；吴穹
关键词：胃癌, 基因表达谱, CD59, DDEF2, DNMT3A
摘要：目的:明确用基因表达水平的贝叶斯分析(Bayesian analysis of gene expression levels,BAGEL)所建立的胃癌弱差异基因表达谱(fold change＜1.5)的特异性及生物学意义.方法:Cluster3.0聚类分析基因DNA甲基转移酶3A[DNA(cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha,DNMT3A]、发育分化增强因子2(development and differentiation-enhancing factor 2,DDEF2)、分化群59(cluster of differentiation 59,CD59)的表达；机器学习和模式识别技术对弱差异基因表达谱(fold change＜1.5,P＜0.001)进行特征提取;GoMiner 软件分析弱差异表达基因DNM T3A、DDEF2、CD59的生物学功能;RT-PCR在实验室验证弱差异表达基因DNMT3A、DDEF2、CD59在胃癌及癌旁配对组织中mRNA的表达水平.结果:从弱差异基因表达谱中得到能够识别样本类别的62个分类特征基因和4个分类能力较强的基因；GoMiner分析表明这组基因参与细胞黏附、细胞吞噬、免疫调节、基因甲基化、转录调控等重要生物学作用;RT-PCR确定基因表达变化与芯片中基因表达谱的数据一致,证实了弱差异基因表达谱的可靠性和灵敏性.结论:通过BAGEL分析得到的fold change＜1.5的弱差异基因表达谱灵敏可靠,在肿瘤发生发展中关系密切.
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